Centre d'analyse et banque d'échantillons biologiques (BBC)
Le BBC sera situé à l’Université McMaster et consistera en un laboratoire dédié à l’analyse détaillée d’échantillons pour répondre à un éventail de questions de recherche. Le BBC suivra les principes suivants : entreposage optimal, contrôle de qualité rigoureux, sécurité stricte et efficacité. Comme la majorité des tests seront faits un certain temps après le recrutement, des méthodes de collecte, de traitement, d’expédition et d’entreposage des échantillons biologiques doivent être mises sur pied pour conserver l’intégrité à long terme des échantillons et, ainsi, assurer la précision des mesures de biomarqueurs.
La valeur des échantillons biologiques pour des recherches éventuelles dépend étroitement de leur entreposage. Le laboratoire du BBC sera axé sur un système flexible automatisé de manutention des liquides associé à un cytomètre de flux intégré pour l’étude des cellules, un cytomètre Bioplex avec technologie X-MAP pour l’identification de protéines et de petits analytes, ainsi qu’un lecteur de plaques spectrofluorimètre pour les analyses fonctionnelles et l’analyse d’autres protéines, tel l’ELISA.
Cette technologie est conçue pour assurer la flexibilité et l’efficacité lors de l’utilisation d’échantillons individuels. De plus, des préparations d’ADN, d’ARN et de membrane seront effectuées pour d’autres chercheurs, ce qui montre bien la grande flexibilité du système. L’efficacité sera démontrée par l’analyse concurrente de plusieurs analytes en utilisant différentes technologies. L’utilisation de chaque cryovial réduit le besoin de recongélation, évitant ainsi la dégradation qui pourrait être causée par le processus de gel-dégel.
Bien que les travaux du laboratoire se concentrent autour de cette technologie, des instruments d’analyse à petite échelle seront disponibles comme de l’équipement pour la culture cellulaire (p.ex. incubateurs, hotte à flux laminaire) et pour l’électrophorèse; il sera également possible d’en ajouter au besoin (p. ex. un spectrophotomètre de masse).
Les données recueillies dans les onze sites de collecte de données et centres ETAO seront envoyés en premier vers le Centre national de coordination. Ce dernier sera responsable du contrôle des données et entretiendra un contact étroit avec le personnel responsable de la capture de données pour répondre à leurs requêtes et modifier les procédures au besoin. Tout au long de l’ÉLCV, les responsabilités du personnel du Centre national de coordination seront de tenir les modes opératoires normalisés à jour, offrir une formation normalisée et un perfectionnement au personnel de recherche, et coordonner les demandes d’examen en comité d’éthique à travers le pays.
Les activités quotidiennes de ce Centre sont d’interagir avec les employés des sites de collecte de donnée pour leur donner de la formation, du soutien au niveau du fonctionnement ou des procédures pour tous les aspects du recrutement, de la collecte de données, de la validation de données et du transfert final des données vers le Centre d’analyse statistique. Le Centre national de coordination est formé du coordinateur national de l’ÉLCV, d’un directeur des communications, d’un gestionnaire financier, de chercheurs, d’un gestionnaire des données, ainsi que du personnel, des coordinateurs des données, des assistants de recherches et des cadres supérieurs (c.-à-d. les responsables de la conception de l’étude, de l’expertise en technologie médicale, etc.) pour former le personnel responsable de la collecte de données et les techniciens à chaque site de collecte de données. Son infrastructure comprendra un serveur local, de l’équipement de réseautage, des imprimantes, un scanneur et 24 postes de travail.
Le mandat du Centre national de coordination comprendra également des objectifs scientifiques en vue de la mise sur pied et de l’exécution de recherches méthodologiques tout au long de l’ÉLCV visant à améliorer la capture de données et l’analyse de données provenant d’études longitudinales, ainsi que d’en améliorer la méthodologie. Les bureaux du Centre national de coordinateur seront situés dans un espace d’une superficie de 2 800 pi. ca. abritant de l’équipement informatique et de communications modernes et des postes de travail efficaces et sécurisés.